法律分析：签了事业单位的三方协议中约定了违约金条款的，有违约金。签了事业单位的三方协议中没有约定违约金内容的，违约方可以不予赔偿，但是必须跟公司协商解决。如果单位要求缴纳违约金的，需要缴纳违约金。但事业单位在劳动者试用期期间支付了培训费用的，劳动者违约离职时要补偿给单位相应的培训费。
一、事业单位辞职违约金吗
《劳动合同法》规定：违约金情形法定原则，只用两种情形你才需要交纳违约金，1、单位对你采取了专项技术培训；2、你违反了竞业限制义务，即你辞职后一定时间内到别的医院做同样的工作。除此之外，合同中的违约金条款无效。
二、签三方违约金一定要赔吗
无需交违约金，因为如果没有就业单位提供专项培训、约定服务期，从业人员无须承担违约责任。
劳动合同法上规定的违约金只有两方面，即违反服务期约定的违约金和违反竞业限制义务违约金，除此以外，不允许设定违约金，即便设定，也因违法而无效。就接收单位而言，企业与个人签订三方协议，也就意味着可以接收毕业生档案，并保障学生的上述权利。
《劳动合同法》第二十五条 除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
法律依据：
《民法典》
第五百七十七条
当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第四百六十五条
依法成立的合同，受法律保护。依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。
法律依据：《中国人民共和民法典》
第五百七十七条
当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第四百六十五条
依法成立的合同，受法律保护。依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。
