请假制度规定超过3天不请假缺勤算自动离职违法，具体原因如下：
1、原劳动部办公厅《关于自动离职与旷工除名如何界定的复函》曾经明确，“自动离职”是指职工擅自离职的行为。即职工根据企业和自身情况擅自离职，而强行解除与企业的劳动关系的一种行为。如辞职未准擅自离职；未说明原因不辞而别；受优厚待遇诱惑而擅自“跳槽”等；
2、原劳动部曾经规定，旷工是指非不可抗力因素，职工既不请假，或者请假未被批准，而不出勤。职工不请假3天未上班，应属于旷工。但旷工并非自动离职，《中华人民共和国劳动合同法》已经废止了自动离职一说，用人单位规定旷工3天算自动离职与法律法规精神相悖，属于无效规定。
旷工三天是否合法？
律师回答
摘要：请假制度规定超过3天不请假缺勤算自动离职违法，原因如下：1、《关于自动离职与旷工除名如何界定的复函》明确自动离职是指职工擅自离职行为，如辞职未准擅自离职等；2、旷工不属于自动离职，劳动合同法已废止自动离职规定，用人单位规定旷工3天算自动离职违法。
延伸阅读
旷工三天的法律后果是什么？
旷工三天的法律后果是严重的。根据劳动法规定，雇员应按时履行劳动合同约定的工作职责，旷工违反了这一义务。雇主有权采取相应的纪律处分措施，如扣除工资、警告甚至解雇雇员。此外，旷工还可能导致工资、福利、奖金等各种权益的损失。在劳动争议仲裁或法庭诉讼中，雇员可能需要承担违约责任，赔偿雇主因旷工造成的损失。因此，雇员应该严格遵守工作纪律，避免旷工行为，以免承担法律后果。
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结语：请假制度规定超过3天不请假缺勤算自动离职违法。根据《关于自动离职与旷工除名如何界定的复函》和《中华人民共和国劳动合同法》的规定，自动离职是指职工擅自离职的行为，而旷工并非自动离职。用人单位规定旷工3天算自动离职与法律法规精神相悖，属于无效规定。旷工行为可能导致严重后果，包括纪律处分、工资扣除、甚至解雇。因此，雇员应严格遵守工作纪律，避免旷工行为，以免承担法律后果。
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条
劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
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（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
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