企业根据国家有关政策规定，为在本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，分别在不超过职工工资总额
5%标准内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除；超过的部分，不予扣除。
一、补充医疗保险比例
补充医疗保险主要是由单位自行办理的，可以按照单位职工的工资总额的4%为计提，税前列支，有单位的会开设专业户进行管理，实行专款专用。根据相关法律规定，企业按照国家统一为职工缴纳的五险一金的费用，准予扣除，企业为职工支付的补充医疗保险的费用，补充养老保险费用，在国家财务部规定的范围和标准内是可以准予扣除的。企业补充医疗保险的资金是有企业和行业集中使用和管理，主要用于本企业个人负担较重的退休人员和职工的医药费用补助，不得划入基本医疗保险的个人账户中，也不得另行建立个人账户或用于职工其他方面的开支。
二、补充医疗缴费基数和比例
1、这个每个地区也是不完全一样的。以某地为例，首先要确定一个缴纳基数，各项费用是以职工上年的全年平均工资为缴费基数(新招用人员以第一个月工资或者劳动合同规定工资为缴费基数)按比例计算，个人缴纳比例为税前工资的2%+3元，单位为10%。其他地区也有差别，但不会相差过大。
2、企业补充医疗保险费在工资总额5%以内的部分，企业可直接从成本中列支，不再经同级财政部门审批。基本医疗保险的企业和事业单位可以建立企业补充医疗保险。企业补充医疗保险费在本企业职工工资总额4%以内的部分，列入成本。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国税收征收管理法》
第一条为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行;法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
第四条法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
法律、行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。
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