律师分析：
一、对应法院层级不同。《人民检察院刑事诉讼规则(试行)》第三百六十二条规定，各级人民检察院提起公诉，应当与人民法院审判管辖相适应。
二、管辖案件不同。危害国家安全、恐怖活动案件，可能判处无期徒刑、死刑的案件由市检察院管辖，一般案件由区检察院管辖。
三、处理权限不同。市检察院可以提审区检察院的案件。可以对区检察院办理案件提出意见和建议。
【法律依据】：
《人民检察院刑事诉讼规则》 第三百六十二条 各级人民检察院提起公诉，应当与人民法院审判管辖相适应。公诉部门收到移送审查起诉的案件后，经审查认为不属于本院管辖的，应当在五日以内经由案件管理部门移送有管辖权的人民检察院。认为属于上级人民法院管辖的第一审案件的，应当报送上一级人民检察院，同时通知移送审查起诉的公安机关；认为属于同级其他人民法院管辖的第一审案件的，应当移送有管辖权的人民检察院或者报送共同的上级人民检察院指定管辖，同时通知移送审查起诉的公安机关。上级人民检察院受理同级公安机关移送审查起诉案件，认为属于下级人民法院管辖的，可以交下级人民检察院审查，由下级人民检察院向同级人民法院提起公诉，同时通知移送审查起诉的公安机关。一人犯数罪、共同犯罪和其他需要并案审理的案件，只要其中一人或者一罪属于上级人民检察院管辖的，全案由上级人民检察院审查起诉。
需要依照刑事诉讼法的规定指定审判管辖的，人民检察院应当在侦查机关移送审查起诉前协商同级人民法院办理指定管辖有关事宜。
