一、受理案件机构的性质不同。仲裁是由仲裁机构即仲裁委员会受理。
仲裁委员会是由省、自治区、直辖市人民政府所在地的市或其他设区的市的人民政府组织有关部门和商会统一组建的专门仲裁机构，而审判则由人民法院负责，法院是国家机器的重要组成部分，是代表国家行使审判权的机关。
二、对案件的管辖不同。
仲裁机构即仲裁委员会是根据当事人双方自愿达成的仲裁协议受理案件，其对案件的管辖权是基于双方当事人的授权，没有仲裁协议或仲裁协议无效的案件，仲裁机不能受理。而代表国家行使审判权的人民法院则是强制管辖，只要一方当事人向有管辖权的人民法院提起诉讼，人民法院就可依法受理案件。
三、审理组织的组成原则不同。
组成仲裁庭的仲裁员是由当事人各方选定或共同选定或委托仲裁机构指定，其组成是基于当事人的选择，而审判庭的组成则是由人民法院指定，当事人无权过问，只能依法定程序申请回避，是否回避由人民法院决定。
四、仲裁庭审理案件一般不公开进行，案情不公开，裁决不公开，有利于保护当事人的商业秘密和商业信誉，人民法院审理案件实行公开审理原则，但依法不应公开审理的除外。
五、依法实行一裁终局，裁决一经仲裁庭作出即发生法律效力，当事人不能上诉，而法院审判则实行两审终审制，当事人对一审法院判决不服可上诉于上一级人民法院。
