投资设立一家新企业时，选择不同的组织形式，在企业税收负担上会产生很大的差异。哪类企业适用何种组织形式，我们进行一个简要的分析比较。
众所周知，设立企业时，我们目前可以选择合伙企业的形式，或者有限责任公司，或者股份有限公司。不同的组织形式，适用的税收法律是不同的。合伙企业是指自然人、法人和其他组织在中国境内设立的普通合伙企业和有限合伙企业，合伙企业的生产经营所得和其他所得，依照税法规定，由合伙人分别缴纳个人所得税，不构成缴纳企业所得税的居民企业。如自然人投资设立合伙企业，就生产经营所得只需缴纳一次税金，即个人所得税。如设立为公司，既要缴纳企业所得税，还需就股息缴纳20%的个人所得税。因此，自然人投资设立企业在考虑税负的情况下，应选择非法人企业，即合伙企业组织形式。
但在实际生活中，合伙企业受经营条件限制，并不能满足经营者的需要，因此一些法人企业可以选择投资设立下属公司的方式进行税收安排，即选择设立子公司或分公司进行纳税筹划。
按照《中华人民共和国公司法》规定，子公司是独立法人，如果盈利或亏损，均不能并入母公司利润，应当作为独立的居民企业单独缴纳企业所得税。当子公司微利的情况下，子公司可以按20%的税率缴纳企业所得税，使集团公司整体税负降低，在给母公司分配现金股利或利润时，应补税差，则设立子公司对于整个集团公司来说，其税负为子公司缴纳的所得税和母公司就现金股利或利润补交的所得税差额。分公司不是独立法人，不形成所得税的居民企业，其实现的利润或亏损应当并入总公司，由总公司汇总纳税。如果是微利，总公司就其实现的利润在缴纳所得税时，不能减少公司的整体税负，如果是亏损，可抵减总公司的应纳税所得额，当巨额亏损的情况下，从而达到降低总公司的整体税负。
示例一：A公司所得税税率为25%。2008年1月拟投资设立一公司，预测其当年的税前会计利润为3万元，假定A公司当年实现税前会计利润100万元。现有两种方案可供参考：一是设立全资子公司，并向甲公司分配利润2万元;二是设立分公司(假设不存在纳税调整事项)。
1、设立全资子公司情况下集团公司的所得税税负：
子公司缴纳的所得税=3×20%=0.6万元;
A公司缴纳的所得税=100×25%+2÷(1-20%)×(25%-20%)=25.13万元;
集团公司整体税负=0.6+25.13=25.73万元。
2、设立分公司的情况下总公司的所得税税负：A公司缴纳的所得税=(100+3)×25%=25.75万元。
3、比较A公司的整体税负，设立分公司的所得税税负比设立子公司的所得税税负多0.02(25.75-25.73)万元。
从上述实例看出，企业投资设立下属公司，当下属公司微利的情况下，企业应选择设立子公司的组织形式。
示例二：B公司所得税税率为25%，2008年1月拟投资设立回收期长的公司，预测该投资公司当年亏损600万元，假定B公司当年实现利润1000万元，现有两方案可供选择：一是设立全资子公司;二是设立分公司(假设不存在其他纳税调整事项)。
1、设立子公司情况下的所得税税负：
子公司当年亏损，不缴纳所得税，其亏损可结转以后年度，用以后年度所得弥补。
B公司当年缴纳的所得税=1000×25%=250万元;集团公司整体税负=250万元。
2、设立分公司情况下的所得税税负：B公司当年缴纳的所得税=(1000-600)×25%=100万元。
3、比较B公司的整体税负，设立子公司情况下缴纳的所得税比设立分公司缴纳的所得税多缴纳150(250-100)万元。
从上述实例可看出，企业投资设立下属公司，当下属公司亏损的情况下，企业应选择设立分公司的组织形式。综上所述，在设立企业时，要考虑好各种组织形式的利弊，做好所得税的纳税筹划，再决定是设立公司还是合伙企业，是子公司还是分公司。
新税法规范了居民企业和非居民企业概念，居民企业承担全面纳税义务，就其境内外全部所得纳税;非居民企业承担有限纳税义务，一般只就其来源于我国境内的所得纳税。新税法采用了“登记注册地标准”和“实际管理机构地标准”相结合的办法，对居民企业和非居民企业作了明确界定，即依法在中国境内成立，或者依照外国(地区)法律成立，但实际管理机构在中国境内的企业，都将构成中国的居民企业。这一新变化对外资企业影响非常大。如果企业不想成为中国的居民企业，就不能像过去那样仅在境外注册即可，还必须确保不符合“实际管理控制地标准”。外资企业可利用好这一政策，选择纳税身份，达到节税的目的。
新税法还规定，居民企业在中国境内设立不具有法人资格营业机构的，应当汇总计算缴纳企业所得税。这是“登记注册地标准”和“实际管理机构地标准”相结合的办法。
假设一连锁经营企业，外地有10家营业机构，预计未来有半数盈利800万元，半数亏损500万元。如果将其均设立为独立法人，则按照新税法不可汇总纳税，盈利企业须纳税200万元(800×25%)，亏损企业待日后弥补;但如果将其设立为分公司，则可依法汇总纳税，实现盈亏互抵，汇总后的应纳税所得为300万元，须缴所得税75万元，减轻税负125万元;即使上述10家机构均盈利，此时汇总纳税虽无节税效应，但可降低企业的办税成本，提高管理效率。
在新税法下，企业还通过选择优惠税率进行筹划。原内资企业所得税税率为33%，新税法规定法定税率为25%，国家需要重点扶持的高新技术企业为15%，小型微利企业为20%，非居民企业(未在中国境内设立机构场所)为20%。应对税率的变化，具备条件的企业应努力向高新技术企业发展，把握新税法的优惠政策。对于小型微利企业应注意把握新所得税实施条例对小型微利企业的认定条件，掌握企业所得税率临界点的应用。新条例规定的小型微利企业是指从事国家非限制和禁止行业，并符合下列条件的企业：①工业企业，年度应纳税所得额不超过30万元，从业人数不超过100人，资产总额不超过3000万元;②其他企业，年度应纳税所得额不超过30万元，从业人数不超过80人，资产总额不超过1000万元。因此，在进行该税种的纳税筹划时，从税率角度就存在着纳税筹划的空间。
例如，某企业12月31日计算的年应纳税所得额为300100元。则若该企业不进行纳税筹划，其企业所得税的应纳税额=300100×25%=75025元。如果该企业进行了纳税筹划，12月31日去购进一些办公用品支出了100元，该企业应纳税所得额=300100-100=300000元，则应纳税额=300000×20%=60000元。通过纳税筹划支付费用成本仅为100元，却获得节税收益15025元(75025-60000)。由此可知，对企业所得税税率进行纳税筹划的空间是相当大的。

中华人民共和国企业所得税法（2018修正）：第五章 源 泉 扣 缴 第四十条 扣缴义务人每次代扣的税款，应当自代扣之日起七日内缴入国库，并向所在地的税务机关报送扣缴企业所得税报告表。
中华人民共和国企业所得税法（2018修正）：第五章 源 泉 扣 缴 第三十七条 对非居民企业取得本法第三条第三款规定的所得应缴纳的所得税，实行源泉扣缴，以支付人为扣缴义务人。税款由扣缴义务人在每次支付或者到期应支付时，从支付或者到期应支付的款项中扣缴。
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第四章 税收优惠 第八十八条 企业所得税法第二十七条第(三)项所称符合条件的环境保护、节能节水项目，包括公共污水处理、公共垃圾处理、沼气综合开发利用、节能减排技术改造、海水淡化等。项目的具体条件和范围由国务院财政、税务主管部门商国务院有关部门制定，报国务院批准后公布施行。
企业从事前款规定的符合条件的环境保护、节能节水项目的所得，自项目取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第一年至第三年免征企业所得税，第四年至第六年减半征收企业所得税。