律师分析：
进口增值税的抵扣方式如下：1、在海关缴纳关税、增值税，并取得缴款书；2、根据货物明细和缴款书编制抵扣清单，然后录入税务局的采集软件里，从采集软件里导出清单存入U盘；3、带好营业执照、增值税缴款书、申请、抵扣清单纸质版和U盘，去税务局的办税大厅提交抵扣申请；4、从2017年7月1日开始，申请期限是360天，以前是180天。也就是说按缴款书上的时间，360天内要提交抵扣申请，逾期不能抵扣；5、税务机会根据你提交的申请和清单进行审核、比对，数据都正确就会给你下达一个增值税的抵扣凭证。一般是这个月下达上个月的。6、公司凭税务局下达的增值税抵扣凭证就可以抵扣增值税。
【法律依据】：
《中华人民共和国税收征收管理法》
第一条 为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条 凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行;法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
第四条 法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
法律、行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。
