由于所改制的企业资产评估不规范，导致国有资产流失严重。
在企业改制过程中，改制的企业只注重对房产、设备等固定资产的评估，而对企业的商标、专利、商号、名称等无形资产没有进行评估或评估不足。意图从事改制企业经营的人往往从个人私利出发，将企业多年积累的无形资产，试图从企业的资产总额中除去，以达到降低购买股权成本的目的，从而侵占国有资产，将国有资产归为已有。党委、政府为尽快将企业的资产盘活，对无形资产不评估或是少评估，也是常有的事。再者对于资产评估机构是否有资质、有能力对无形资产的价值进行评估，能否对无形资产做出准确的评估，缺乏应有的监督。同时从事改制企业经营的人为达到自己的目的，往往投机钻营，虚增债务或虚减资产，并通过拉关系、托人情，尽量使所评估的资产价值降低，也是致使国有资产流失的原因之一。
(二)企业改制过程中的产权交易市场不完善，缺乏公开透明度。
在企业改制过程中，企业的产权交易往往不进行公开招标和拍卖，党委政府和主管部门多是采用行政手段，与意欲从事改制企业的经营者采取协商转让、零转让的方式，实现企业的改制;国有股未经批准擅自出售，对于国有资产的出售法律有明文规定，必须经具有审批权的部门审批同意后方能出卖。但现实中有很多企业改制国有资产出售是未经批准进行的，出售程序严重违法，最终导致了暗箱操作，没有最大限度地保护好国有资产。而且在实践中，所改制的企业多是资不抵债，无法继续经营的企业。在资不抵债的情况下，债务远远大于资产，这又给了从事改制企业的经营者一些可乘之机，使他们可以不出一分钱，即可用债务抵顶所购企业资产的价值，从而大大获益。另外原企业的陈年老帐在企业改制中未进行清理，对于到底是否有债权人、债权人的能力如何，无债权人或无财产继承人的死帐、呆帐不认真核实的情况，现实中还大量存在。一味地将企业的债务抵顶，势必导致大量的国有、集体资产流向个人所有，最终极大地损害了国家、集体和广大职工的利益。
(三)企业的改制工作缺乏机制制约，逃债、漏债现象依然严重。
在企业改制过程中，企业的上级主管部门、政府的体制改革部门、国有资产管理部门多头并进，没有统一的领导机构和监督机构，所进行的企业改制工作与国有资产产权登记、房地产、工商、税务等政府主管、职能部门脱节,致使这些主管、职能部门不能参与企业的改制工作。特别是对原企业的担保债务尚未得到全部落实的情况下被强行注销登记，新企业虽然接收了资产，但又不承担责任，使债权长期得不到偿还，债权实际被悬空，侵害了债权人的利益。此外，行政部门侧重于本地利益的保护，对企业改制中低估、漏估国有、集体资产、虚增债务的行为“睁一眼闭一眼”。企业改制，还可能导致债务转移给无履行能力的部门，脱壳经营，以使改制企业轻装上阵，侵害债权人的利益。这就是名为改制，实为逃债，损害了债权人和国家、集体和广大职工的利益。还有一种情况就是大股东通过玩“空手道”将国有资产据为己有。其基本做法是自己一点本钱也不出，而是用企业的资产作担保从银行中借款买股，买股后则成为该企业的大股东，用这种手段就把企业搞到了手，获取了巨额利益。改制企业职工出资购买企业资产，组建有限责任公司这一现象，多数情况下职工不会实际出资，而是以企业所欠职工工资等与企业资产相抵消，这种做法表面上看起来是公平合理的，但实质上是一种逃避债务的方法，其结果是本企业职工的权益得以保障，而原企业责任财产灭失。
(四)工资构成因素因改制而出现单一因素工资，工资的合理因素被破坏。
工人的工资是由多种分配要素决定的，这些要素体现着科学合理的分配方式，并包含着工人解决自身生存、赡养父母、孩子教育等费用内容。企业改制前工人的工资还是按规定内容发放，但是企业改制后，一些企业的负责人错误的认为政府管不着改制后的企业了，工人的工资由企业自己说了算，所以就自行制定工资标准：对管理人员实行高工资标准，对工人实行单一的苦力工资标准，并且不少单位低于最低工资标准;有的随意增加计件加大劳动强度，变相延长劳动时间，有的取消工人应有的工龄补贴等必要的福利待遇，有的把月出勤时间规定为25天以上，侵害了职工的法定休息权利和加班待遇。这些规定使得合法的工资构成因素被严重破坏，工人利益受到严重侵犯，特别是为创建企业出力多年的老工人，在企业改制后，由于年老显然不能再从事与其年龄不相符的岗位工作，而只能从事力所能及的工作。因此，按企业的不合理工资标准，这些老工人只能得到单一化微薄工资，难以承担起基本的家庭责任。这样的工资标准在改制企业中普遍存在，已足以影响企业的长久发展和社会稳定。
(五)法院在处理改制企业案件中适用法律方面存在许多困难。
由于企业的改制过程相当复杂和繁琐，不可能面面俱到，加之广大审判人员对于改制案件的审理缺乏整体性的思路，势必导致一些纠纷的发生。对于改制中遗漏的债务、逃废的债务如何处理,最高人民法院虽在2003年1月3日公布了《关于审理与企业改制相关的民事案件若干问题的规定》，但我国公司制改造缺乏规范，对企业担保所形成的债务往往被遗漏，形成了原有企业的“漏债”。《规定》对漏债的承担没有规定，对于诸如评估报告不实，购买者是否承担超出部分的债务;如何理顺新、旧企业的关系，债务承担主体资格等问题均没有做出明确规定。没有可行的法律法规执行，企业改制纠纷的案件也就成为人民法院民商事审判的热点、难点。企业改制纠纷的案件复杂、面广，要慎重处理，人民法院内部也必须上下协调，上级法院指导下级法院审理好企业改制纠纷的案件。否则，将会造成社会不稳定因素。因此，依法规范引导企业改制工作的顺利进行就显得极为重要。
我国各省的国有企业改制面临的一些实际问题都不尽相同，但总体来说，在改制过程当中都多多少少的会造成国有资产不同程度的流失，这当中亦或是直接的国有资本亦或是国有土地，而且直到目前为止，国有企业改制当中的一些基本问题实际上都不足够公开，国有企业当中的职工只能随大流，自主权很难保证。

在企业改制过程中,可能会出现一些法律问题,导致资产流失。例如,企业改制时,可能会涉及到股权转让、土地使用权转让、知识产权转让等问题,如果没有按照法律规定进行操作,可能会导致一些法律风险。

例如,如果企业改制时没有签订必要的合同,或者合同条款不合法,可能会导致合同纠纷。如果企业在改制过程中没有经过必要的审批程序,可能会导致违规操作。此外,企业改制时还可能会涉及到股权转让的价格问题、土地使用权的处置问题、知识产权的归属问题等。

为了避免上述问题,企业改制时必须按照法律规定进行操作,确保所有相关手续都合法合规。企业应该寻求专业的法律意见,并在改制前制定详细的改制计划,避免出现任何法律问题。

中华人民共和国企业国有资产法：第五章 关系国有资产出资人权益的重大事项 第二节 企业改制 第三十九条 本法所称企业改制是指：
（一）国有独资企业改为国有独资公司；
（二）国有独资企业、国有独资公司改为国有资本控股公司或者非国有资本控股公司；
（三）国有资本控股公司改为非国有资本控股公司。
中华人民共和国企业国有资产法：第五章 关系国有资产出资人权益的重大事项 第二节 企业改制 第四十条 企业改制应当依照法定程序，由履行出资人职责的机构决定或者由公司股东会、股东大会决定。
重要的国有独资企业、国有独资公司、国有资本控股公司的改制，履行出资人职责的机构在作出决定或者向其委派参加国有资本控股公司股东会会议、股东大会会议的股东代表作出指示前，应当将改制方案报请本级人民政府批准。
中华人民共和国全民所有制工业企业法（2009修正）：第二章 企业的设立、变更和终止 第二十一条 企业的合并、分立、终止，以及经营范围等登记事项的变更，须经工商行政管理部门核准登记。