农村的宅基地上房屋拆迁补偿是房和地的分开补偿，“分开补偿”是指土地补偿和地上附着物补偿的分离。
新农村建设
1.新农村建设是指不改变农村集体土地的性质，按照《村民委员会组织法》的规定经民主表决同意，建设重新规划的新民居，拆除宅基地上房屋并给予适当补偿。
此类拆迁补偿的合理标准：村民现有居住合法建筑的面积不得减少，生活水平不因此下降。
2.新农村建设不会撤销农村建制。被拆迁人可以在乡(镇)土地利用总体规划确定的中心村或居民点范围内申请宅基地新建住房，并获得相应的货币补偿。
行政村合并的房屋拆迁
1.《村民委员会组织法》第八条规定
村民委员会应当支持和组织村民依法发展各种形式的合作经济和其他经济，承担本村生产的服务和协调工作，促进农村生产建设和经济发展。
村民委员会依照法律规定，管理本村属于村农民集体所有的土地和其他财产，引导村民合理利用自然资源，保护和改善生态环境。
村民委员会应当尊重并支持集体经济组织依法独立进行经济活动的自主权，维护以家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制，保障集体经济组织和村民、承包经营户、联户或者合伙的合法财产权和其他合法权益。
2.行政村合并一般要撤销两个或者多个村建制。被征地的村或者村民小组建制撤销的，以及建制虽然不撤销，但不具备易地建房条件的，被拆迁人可以选择货币补偿，也可以选择与货币补偿金额同等价值的产权房屋调换。它的具体计算是：(被拆拆除房屋建安重置单价结合成新+同区域新建多层商品住房每平方米建筑面积的土地使用权基价+价格补贴)×被拆除房屋的建筑面积。
城中村改造
城中村改造是指村民的身份已变为城镇居民，村民的宅基地业已变为国有，但是原有土地没有经过合法的征收补偿程序。在城中村改造中，拆除村民原有的宅基地上房屋，应要对宅基地进行集体土地变为国有土地的补偿，房屋也要按照现有用途参照周边同类房产的价格给予补偿或者安置。
国家对宅基地上房屋的征收补偿
1.国家征收农村宅基地上房屋，一般分为两种情况：一种是村里再提供宅基地重新建造的方式，这时候拆迁方应依照规定标准向被拆迁房屋的所有权人或使用人支付的各种补偿金。第二种情况，如果本村不再提供宅基地，这种补偿比较复杂。一般情况下按照本地的地价和房屋重置价格进行补偿，会导致被拆迁人生活水平的下降，这与《土地管理法》的相关规定相违背。
2、具体补偿标准：
房屋拆迁货币补偿=合法拥有房产评估价格+房屋装修装饰商定补偿金额(或经评估确定的房屋装修装饰补偿金额);
房屋拆迁补偿差价=合法拥有房产评估价格+房屋装修装饰商定补偿金额或经评估确定的房屋装修装饰补偿金额)-被拆迁人获得调换产权的房屋的评估价格;
房屋拆迁安置费=搬迁补助费+没有提供周转房情况下的临时安置补助费+超过过渡期限的临时安置补助费+非住宅房屋因停产、停业造成的损失赔偿费。
