发票丢了有以下两种处理方法：
1.增值税票丢失：把存根联复印，交客户当地主管税务局确认并出具未抵扣税证明，报本公司主管税务局后，开具红字发票冲原开发票，再重新填开发票给客户。如果已抵扣税不得重开。
2.普通发票丢失，复印存根联并盖章给客户入账。财务人员应该设置发票登记本，登记购入发票的数量、号码，开出的发票号码、日期、客户、金额、领取人，送给客户要客户回签，避免麻烦。
一般纳税人丢已开具专用发票的抵扣联，这种情况的增值税发票丢失怎么办。如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票联复印件留存备查。如果丢失前未认证的，可使用专用发票的发票联到主管机关认证，专用发票的发票联复印件留存备查。
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联，这种情况的增值税发票丢失怎么办。可以将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。
销售方丢失，一张发票罚款100左右，然后需要登报，会影响到公司的纳税信用等级。按照《发票管理办法》及《国家税务总局关于被盗、丢失增值税专用发票的处理意见的通知》（国税函发[1995]292号）文的规定，丢失专用发票需要在中国税务报上刊登遗失声明，税务机关视情节，有权处以1万元以下的罚款。
法律依据：
《中华人民共和国发票管理办法》
第三十六条
未按规定保管发票，导致发票丢失，税务机关可以处1万元以下罚款。据此，发票管理相对人违反发票管理有关规定，造成发票丢失，将承担1万元以下罚款的法律责任。而法律责任是法律对过错行为予以否定评价的表现。可见过错行为是引起法律责任的前提条件。现实中造成发票丢失的原因较为复杂，但归纳起来不外乎丢失发票的当事人主观上有过错和主观上无过错两种。尽管两种情况都存在丢失发票这一客观事实，但其所负法律责任不可一概而论，而应区别对待。
