被征地人可申请行政复议和提起行政诉讼。如果征地主体违反征地程行为同时构成对被征地人合法权益侵害的，还必须依照国家赔偿法的规定承担行政赔偿责任。为了保证征地权的有序运行，征地主体必须按照法定程序履行义务，如果征地主体违背法定的程序，就要承担相应的法律责任。
1、行为被确认违法、撤销、变更及被要求重新做出的责任
我国《行政复议法》第28条规定对违反法定程序的，复议机关按照下列规定作出行政复议决定：决定撤销、变更或确认该具体行政行为违法;决定撤销或者确认该具体行政行为违法的，可以责令被申请人在一定期限内重新做出具体行政行为。我国《行政诉讼法》第54条第2项规定：对违反法定程序的，判决撤销或者部分撤销，并可以判决被告重新做出具体行政行为。
考虑行政程序本身的特点，我国行政诉讼法一方面规定违反程序可以导致行政行为被确认违法以至被撤销，宣告无效，同时，又补充规定，违反程序在某些情况下即使被宣告违法，也未必会导致行政行为被撤销的结果。最高人民法院《关于执行中华人民共和国行政诉讼若干问题的解释》第58条规定：具体行政行为违法，但撤销该具体行政行为将给国家利益或者社会利益造成巨大损失的，人民法院应当作出确认被诉具体行政行为违法的判决，并责令被诉行政机关采取相应的补救措施。从实践来看，我国对违反程序的行为区分如下情况：第一，以程序瑕疵不影响权利义务为由，不认定行政行为违法;第二，严重违反程序，确认违法;第三，确认违法，并撤销原具体行政行为。在我国土地征收中，因程序违法而导致行政行为被认定违法并撤销的情况并不多见。如广州大学城这一占地43.3平方公里，其中有2万多亩耕地，1万5千亩基本农田的大规模拆迁案，法院最终仍然是在认定程序违法的前提下，支持了政府的征地和拆迁决定。
对程序违法行为在某些情况下不撤销或宣告无效，行为效力未受影响，但这并非意味着这种行为可不受追究，政府及土地行政主管部门仍应承担其相应的程序违法后果。如我国行政处罚法第55条、行政复议法第34条均规定，违反程序规定的，由上级机关或有关部门责令改正;对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。人民法院也可以据此发出司法建议。
2、行政赔偿责任
我国《土地管理法》第78条第2款规定：非法批准征用、使用土地，对当事人造成损失的，依法应当承担赔偿责任。我国《国家赔偿法》第4条第3款规定：违反国家规定征收财物的，受害人有请求赔偿的权利。我国《行政诉讼法》第67条规定：公民、法人或者其他组织的合法权益受到行政机关或者行政机关工作人员作出的具体行政行为侵害造成损失的，有权请求赔偿。最高人民法院《关于执行中华人民共和国行政诉讼若干问题的解释》第59条2款规定：被诉具体行政行为违法，造成损害的依法判决承担赔偿责任。从上述法律规定来看，我国确定了土地征收侵权的行政赔偿制度。政府及土地行政主管部门在征收的过程中违反了《宪法》、《土地管理实施条例》等法律和法规，并造成了被征收人土地权益受损的后果的，符合国家赔偿要件。所以，被征收人可以选择行政诉讼的途径对自己的权益进行救济。人民法院在审理此类案件时，可适用国家赔偿法、行政法等法律的相关规定。在赔偿的范围计算上，依《国家赔偿法》第28条规定，对公民、法人或其他组织造成财产损害的，按直接损失给予赔偿，不赔偿间接损失。
虽然我国征地程序违法的责任制度不承认政府及土地行政主管部门所属的工作人员具有外部主体资格，不能成为外部侵权责任主体，但从内部来说，还是作为主体存在的，对各级政府及土地行政主管部门所属的工作人员有故意和重大过失的，我国国家赔偿法确立了行政追偿责任制度。行政追偿中，政府及各级土地行政主管部门的工作人员承担的是一种财产责任，但不能因此代替行政处分。
一、征地补偿纠纷怎么处理
法律处理方式主要有行政诉讼、行政复议、行政复议裁决、民事诉讼、征地补偿协调、裁决等方式，根据个案的不同特点应当启动不同的法律程序。
1、征地纠纷行政诉讼：是指公民法人对具体行政行为不服而向人民法院起诉，有人民法院进行审理并作出判决、裁定的司法程序。即通常我们所说的民告官，这是解决行政争议的重要制度。行政诉讼的受案范围为对拘留、罚款、吊销许可证和执照、责令停产停业、没收财物等行政处罚不服的；对限制人身自由或者对财产的查封、扣押、冻结等行政强制措施不服的；认为行政机关侵犯法律规定的经营自主权的；认为符合法定条件申请行政机关颁发许可证和执照，行政机关拒绝颁发或者不予答复的；申请行政机关履行保护人身权、财产权的法定职责，行政机关拒绝履行或者不予答复的；认为行政机关没有依法发给抚恤金的；认为行政机关违法要求履行义务的；认为行政机关侵犯其他人身权、财产权的。
2、征地纠纷行政复议：是指公民、法人或者其他组织不服行政主体作出的具体行政行为，认为行政主体的具体行政行为侵犯了其合法权益，依法向法定的行政复议机关提出复议申请，行政复议机关依法对该具体行政行为进行合法性、适当性审查，并作出行政复议决定的行政行为。是公民，法人或其他组织通过行政救济途径解决行政争议的一种方法。
3、征地纠纷中的民事诉讼。在征地纠纷中，大多数进行的诉讼属于行政诉讼，民事诉讼时为数不多的，但是并不是所有的程序都要走行政诉讼，有时候也可以走民事诉讼的程序，如对于非法占地的行为，从民事角度考虑我们可以起诉民事侵权，要求停止侵害、赔偿损失、恢复原状。对于已经签订征地补偿协议，如果该协议签订过程中存在胁迫等手段，则从民事诉讼的角度起诉撤销该协议。
4、征地补偿协调裁决。征地补偿裁决也可以称之为征地补偿协调与裁决，是指对补偿标准有争议的，由县级以上地方人民政府协调；协调不成的，由批准征用土地的人民政府裁决，这是国家为减少、解决征地纠纷而推行的制度。机制可以分为两个部分，一是协调，而是裁决，协调是裁决的前置，未经协调的不能进入裁决。
5、征地纠纷听证制度。征地纠纷听证制度是指在土地征收纠纷中拟作出行政处罚、行政许可决定，制定规章和规范性文件时，主管部门组织听证，应当遵循公开、公平、公正和便民的原则，充分听取公民、法人和其他组织的意见，保证其陈述意见、质证和申辩的权利的制度。它可以分为两类，一类是主管部门依职权组织的听证，一种是申请人申请才组织的听证。