购房合同补充协议不公平是无效的，可以申请合同无效。根据我国相关的法律规定，下列合同，当事人一方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销：(一)因重大误解订立的；(二)订立合同显失公平的。
购房合同的补充协议是否有法律效力，补充协议与原合同具有同等法律效力
只要是双方自愿签署的，没有强迫的情况，有法律效力。依法成立的合同，自成立时生效。
依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。
【法律依据】
《中华人民共和国民法典》第五百零二条，依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。
购房合同的补充协议是否有法律效力
只要是双方自愿签署的，没有强迫的情况，有法律效力。依法成立的合同，自成立时生效。依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。
购房合同中的补充协议是否是有效的
购房合同里的补充协议满足下列条件是有效的：当事人具有相应民事行为能力人；当事人意思表示真实；补充协议的内容不违反法律或行政法规的强制性规定；法定其他有效条件等。
补充协议效力是否大于合同效力
补充协议如果是当事人依法订立的，效力大于合同效力。因为补充协议是对合同未约定事项或约定不明的事项的补充，因此二者相冲突的，应当适用补充协议的有关约定。
借名购房合同是否具有法律效力
借名购房合同一般是具有法律效力。但主体不适格、意思表示不真实、违反法律规定等情形除外。例如，当事人不具备本地的购房限制条件，为规避相关制度而借名买房的，该借名购房合同无效。
