一、公司三个月不发工资能否直接起诉
1、用人单位拖欠工资三个月的，一般不能直接向人民法院起诉。
2、劳动者可以向法院申请支付令，或者申请劳动仲裁追讨劳动报酬。
3、《中华人民共和国劳动合同法》第三十条【劳动报酬】用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：
(一)因确认劳动关系发生的争议;
(二)因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议;
(三)因除名、辞退和辞职、离职发生的争议;
(四)因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议;
(五)因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议;
(六)法律、法规规定的其他劳动争议。
第五条发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解;不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁;对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
二、被拖欠工资什么时候可以申请劳动仲裁
首先，公司在约定时间内未支付工资的，即属于拖欠员工工资。
其次，公司拖欠员工工资后，只要在劳动关系存续期间，其实员工申请劳动仲裁时间不受限制。
不过，实践中发现公司有故意拖欠工资的行为，拖欠一周以上的就可以去劳动部门投诉。并且，投诉之后还是继续拖欠的，员工即可以去申请劳动仲裁处理。
另外，如果公司找出其他理由拖欠工资，那么按正常发放工资日期推迟半个月不发，并且没有明确发工资日期或者以其他借口不肯支付工资的，员工可以不用继续等待，直接去申请劳动仲裁处理。
最后，员工申请劳动仲裁时要按照以下步骤进行：
1、先要准备好如下材料：
(1)劳动争议申诉书一式三份;
(2)到工商局查询公司的工商登记资料一份;
(3)本人的身份证复印件一份;
(4)复印证据资料一式三份，如劳动合同或协议、工资单、工牌、上班打卡记录、同事的证人证言等。
2、向有管辖权的劳动仲裁委员会申请仲裁，一般都是向所在区、县的劳动仲裁委员会申请仲裁。
依据《劳动合同法》的规定，用人单位拖欠劳动报酬三个月的，不能直接向法院起诉追讨工资，但可以向人民法院申请支付令，或者向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，对劳动仲裁的裁决结果不服的，可以向人民法院起诉，追讨拖欠的工资。
