农民工工资超过5000扣税标准是超过的部分按照百分之三至百分之四十五的超额累进税率扣除。扣税申报的方式有上门申报、邮寄申报和数据电文申报三种。
一、农民工工资超过5000怎么扣税
农民工工资超过5000扣税标准是：工资超过五千的部分适用3%—45%的超额累进税率进行扣税。
应纳税所得额=工资收入金额－各项社会保险费－起征点（5000元）。应纳税额=应纳税所得额x税率-速算扣除数。
二、扣税申报的方式有哪几种
扣税申报的方式有以下几种：
1.上门申报，纳税人或是扣缴人可以在纳税申报期间内到主管部门的办理大厅进行办理纳税申报工作。
2.邮寄申报，纳税人采取邮寄方式办理纳税申报的，应当使用统一的纳税申报专用信封，并以邮政部门收据作为申报凭据。邮寄申报以寄出的邮戳日期为实际申报日期。
3.数据电文申报，纳税人采取电子方式办理纳税申报的，应当按照税务机关规定的期限和要求保存有关资料，并定期书面报送主管税务机关。
三、个人所得税扣税有档次划分吗
个人所得税扣除标准没有档次划分，扣除标准如下：
1.在子女教育方面，纳税人子女从年满3岁开始一直到整个全日制学历教育阶段的支出，按照每孩每月1000元标准扣除。
2.在继续教育方面，纳税人接受学历学位继续教育的，按每月400元的标准扣除，接受技能人员和专业技术人员职业资格继续教育的，在取得证书的当年按3600元的标准扣除。
3.在大病医疗方面，纳税人或其配偶、未成年子女医保目录范围内自付的医药费用超过1.5万元部分，在每年8万元限额内据实扣除。
4.在住房贷款利息方面，纳税人或其配偶发生的首套住房贷款利息支出按每月1000元的标准扣除。目前的起征点是5000元。
农民工工资怎么扣税
律师回答
摘要：农民工工资超过5000扣税标准是超过的部分按照百分之三至百分之四十五的超额累进税率扣除，扣税申报方式有上门申报、邮寄申报和数据电文申报三种。个人所得税扣除标准包括子女教育、继续教育、大病医疗和住房贷款利息等方面，没有档次划分。
延伸阅读
结语：农民工工资超过5000的部分将按照3%至45%的累进税率进行扣税。扣税申报可选择上门申报、邮寄申报或数据电文申报三种方式。个人所得税扣除标准没有档次划分，包括子女教育、继续教育、大病医疗和住房贷款利息等方面的支出可以按照相应标准进行扣除。目前的起征点为5000元。
法律依据
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第七章 征收管理 第一百二十五条 企业汇总计算并缴纳企业所得税时，应当统一核算应纳税所得额，具体办法由国务院财政、税务主管部门另行制定。
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第七章 征收管理 第一百二十七条 企业所得税分月或者分季预缴，由税务机关具体核定。
企业根据企业所得税法第五十四条规定分月或者分季预缴企业所得税时，应当按照月度或者季度的实际利润额预缴；按照月度或者季度的实际利润额预缴有困难的，可以按照上一纳税年度应纳税所得额的月度或者季度平均额预缴，或者按照经税务机关认可的其他方法预缴。预缴方法一经确定，该纳税年度内不得随意变更。
中华人民共和国企业所得税法（2018修正）：第八章 附 则 第五十七条 本法公布前已经批准设立的企业，依照当时的税收法律、行政法规规定，享受低税率优惠的，按照国务院规定，可以在本法施行后五年内，逐步过渡到本法规定的税率；享受定期减免税优惠的，按照国务院规定，可以在本法施行后继续享受到期满为止，但因未获利而尚未享受优惠的，优惠期限从本法施行年度起计算。
法律设置的发展对外经济合作和技术交流的特定地区内，以及国务院已规定执行上述地区特殊政策的地区内新设立的国家需要重点扶持的高新技术企业，可以享受过渡性税收优惠，具体办法由国务院规定。
国家已确定的其他鼓励类企业，可以按照国务院规定享受减免税优惠。
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第七章 征收管理 第一百二十七条 企业所得税分月或者分季预缴，由税务机关具体核定。
企业根据企业所得税法第五十四条规定分月或者分季预缴企业所得税时，应当按照月度或者季度的实际利润额预缴；按照月度或者季度的实际利润额预缴有困难的，可以按照上一纳税年度应纳税所得额的月度或者季度平均额预缴，或者按照经税务机关认可的其他方法预缴。预缴方法一经确定，该纳税年度内不得随意变更。
中华人民共和国企业所得税法（2018修正）：第八章 附 则 第五十七条 本法公布前已经批准设立的企业，依照当时的税收法律、行政法规规定，享受低税率优惠的，按照国务院规定，可以在本法施行后五年内，逐步过渡到本法规定的税率；享受定期减免税优惠的，按照国务院规定，可以在本法施行后继续享受到期满为止，但因未获利而尚未享受优惠的，优惠期限从本法施行年度起计算。
法律设置的发展对外经济合作和技术交流的特定地区内，以及国务院已规定执行上述地区特殊政策的地区内新设立的国家需要重点扶持的高新技术企业，可以享受过渡性税收优惠，具体办法由国务院规定。
国家已确定的其他鼓励类企业，可以按照国务院规定享受减免税优惠。
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