变更烟草证法人流程如下:1、申请人持相关材料向工商窗口提交申请,工商初审通过,开具《受理通知书》;不符合受理条件的,当场一次性告知申请人应当补正的全部材料;2、工商局对提交的申请材料进行内部审核,2-5个工作日即可领取新的营业执照;3、法人变更的申请人在提交了以上所需要的提交的资料和完成公司股东变更所需要的程序,我们的公司股东资格就发了变化。新的股东将取代原来的股东行使自己的权利和履行自己的义务。《烟草专卖许可证管理办法》第三十一条烟草专卖许可证的持证人改变经营地址(因道路规划、城市建设等客观原因除外)或者具有国家烟草专卖局规定的其他情形的,应当重新申领烟草专卖许可证;所持有的烟草专卖许可证其他登记事项发生改变的,应当及时变更烟草专卖许可证。第四十七条烟草专卖品生产经营企业法人资格发生变更,需要收回烟草专卖许可证的,发证机关应当及时收回。