法律分析：一、加班迟到算迟到吗
算迟到，应当减扣加班费。
法律依据：
《中华人民共和国劳动法》
第三条 劳动者享有平等就业和选择职业的权利、取得劳动报酬的权利、休息休假的权利、获得劳动安全卫生保护的权利、接受职业技能培训的权利、享受社会保险和福利的权利、提请劳动争议处理的权利以及法律规定的其他劳动权利。
劳动者应当完成劳动任务，提高职业技能，执行劳动安全卫生规程，遵守劳动纪律和职业道德。
第四十一条 用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过1小时特殊原因需要延长工作时间的在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。
二、公司可以制定规章制度，约束员工行为，主要有：
1、在劳动合同中约定员工未完成劳动定额或承包任务，公司可以发放最低工资，扣除标准：
经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
2、在员工手册、规章制度中明确违纪处罚规定，并经公司员工同意。
虽然按规定公司没有罚款的权利，但是可以在员工手册或是规章制度中规定，一旦员工出现违纪情况，可以向员工说明违纪及处罚情况。不过，这些处罚规定必须向员工们公示，并经员工同意，否则对员工无效。
3、以奖代惩，跟员工约定奖金的获得规则，比如"全勤奖”。
为促进员工积极性，公司可以设定奖金，若是员工未达到获奖资格，公司就不会发奖金。所以，这其实也是罚款的另—种方式。
三、因员工原因给公司造成经济损失的情况有：
1、劳动者违反规定的条件解除劳动合同或者违反劳动合同中约定的保密事项，对用人单位造成经济损失的，应当依法承担赔偿责任；
2、因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失；
3、劳动者严重违反用人单位的规章制度，给用人单位造成重大损害的等情形的，用人单位可以单方解除劳动合同，并要求劳动者赔偿损失。
【法律依据】
《行政处罚法》第二条，行政处罚是指行政机关依法对违反行政管理秩序的公民、法人或者其他组织，以减损权益或者增加义务的方式予以惩戒的行为。
《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》
第三条 劳动者享有平等就业和选择职业的权利、取得劳动报酬的权利、休息休假的权利、获得劳动安全卫生保护的权利、接受职业技能培训的权利、享受社会保险和福利的权利、提请劳动争议处理的权利以及法律规定的其他劳动权利。
劳动者应当完成劳动任务，提高职业技能，执行劳动安全卫生规程，遵守劳动纪律和职业道德。
第四十一条 用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过1小时特殊原因需要延长工作时间的在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。
