法律分析：一、医生在合同期内辞职要交违约金吗
辞职不需要支付违约金，劳动合同法中规定需要向单位支付违约金的只有两种情形：
第一种：劳动者违反合法的“约定服务期的”
《劳动合同法》第22条规定，用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
违约金计算：违约金的数额≤培训费用，同时违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
单位以为劳动者办户口、提供住房、车辆等福利为理由而设定服务期及违约金的做法，都不合法，员工不需要支付违约金，但若员工违反了诚实信用原则，不遵守约定给单位造成损失的，用人单位可以要求劳动者赔偿损失。
第二种：签了竞业限制协议的
如果员工和单位签了竞业限制协议，那么该职工不得违反，否则根据《劳动合同法》第23条规定，职工应当按照协议约定向用人单位支付违约金。
需要注意的是，该协议只对单位的高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员有效，其它职工即使签了也对其没有约束力的。
二、医院在编人员辞职流程是哪些？
1、提交个人辞职申请、《事业单位工作人员辞职申请表》，均需院系部处领导签字盖章;
2、报人事处提交请示报医院主管领导审批、发文公布;
3、领取同意辞职文件、离院通知单，办理离院手续;
4、至综合科办理社保视同缴纳证明;
5、提交调档函(注明接收单位地址、邮编，接收人姓名及联系方式)，人事处将个人档案寄出。
综合上面所说的，劳动合同中约定的违约金只存在两种情况，一种是单位提供了培训的费用而劳动者违反，另一种是双方签订了竞业的限制条款而劳动违反了其中的条款，这样劳动在辞职时才需要承担，所以，不同的情形所处理的方式就会不同。
法律依据：《劳动合同法》第22条
用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
