在深圳办理港澳通行证需要基本材料：
1、填写完整的《中国公民出入境证件申请表》（在办证大厅现场填写）。
2、提交《广东省出入境证件数字相片采集回执》。
3、交验有效居民身份证。
未满16周岁的申请人，根据实际情况还需准备：
1、未满16周岁的申请人如未办理居民身份证，可提交户口簿（在居民身份证领取、换领、补领期间，可以交验本人临时居民身份证）。
2、对于未满16周岁的申请，须提交监护关系证明（如出生证明、户口簿等）及监护人身份证明复印件并交验原件（户口簿如可完成系统核查的，则无需提交）；监护人无法陪同而委托他人陪同的，还须提交监护人委托书原件以及陪同人的居民身份证或者护照等身份证复印件并交验原件。
法律依据:
《中华人民共和国出境入境管理法》
第九条
中国公民出境入境，应当依法申请办理护照或者其他旅行证件。中国公民前往其他国家或者地区，还需要取得前往国签证或者其他入境许可证明。但是，中国政府与其他国家政府签订互免签证协议或者公安部、外交部另有规定的除外。中国公民以海员身份出境入境和在国外船舶上从事工作的，应当依法申请办理海员证。
第十条
中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定。具体管理办法由国务院规定。
