对于交通事故伤残鉴定的费用由申请进行鉴定的人承担。伤残鉴定的费用应当由申请人先行承担费用，最后根据各方的责任比例进行支付。除此之外，其他的检验、鉴定费用一般由公安机关交通管理部门承担。
因交通事故案件涉及的法律繁多，难免导致审理结果出现差异，在实务中通常不判决鉴定费与诉讼费由保险公司承担，也有个别案例判决由保险公司承担。
对于鉴定费与诉讼费承担问题，保险公司通常根据《机动车交通事故强制保险条款》第十条规定：“下列损失和费用，交强险不负责赔偿和垫付：（四）因交通事故产生的仲裁或者诉讼费用以及其他相关费用。”这一条往往成为在案件中保险公司不予承担诉讼费和鉴定费的抗辩依据，但是保险公司的抗辩能否成立有待商榷。
在实践中，审理交通事故案件，一般采用第二种意见。
《办法》规定谁主张谁负担的原则，决定由举证方支付的鉴定费用，仅仅指在诉讼过程中由举证方先垫付，如果最后确定责任在于哪方则人民法院在案件审结后在裁判书中确定由哪方最后支付。
败诉方承担诉讼费用是诉讼费用承担的一般原则。是对败诉方消耗司法资源的一种制裁，基于司法资源与诉讼费用相一致的原理，诉讼费用由败诉方承体现了法律的公平、公正。可以防止民事主体滥诉，减少和防止司法资源无味的浪费，维护国家主权和其经济利益。
