个人所得税的扣除是直接从公司扣取，工资发之前就已经扣除了。个人工资扣除各种保险后达到5000元时就要扣缴个人所得税了。个人所得税是调整征税机关与自然人（居民、非居民人）之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。个税计算方式：
个人所得税按照当月发放工资的总额计算。
应纳税所得额＝工资收入金额－各项社会保险费－起征点（5000元）
应纳税额＝应纳税所得额x税率－速算扣除数
个人所得税是对个人（自然人）取得的各项所得征收的一种所得税。个人所得税起征点是指国家为了完善税收体制，更好的进行税制改革，而制定的税收制度。
个人所得税是扣除还是发放？
律师回答
摘要：个人所得税是对个人所得征收的一种税收，根据工资收入金额减去各项社会保险费和起征点（5000元）计算应纳税所得额，再根据税率和速算扣除数计算应纳税额。个人所得税起征点是为了完善税收体制和进行税制改革而设立的税收制度。
延伸阅读
个人所得税的计算方式和应缴税款如何确定？
个人所得税的计算方式和应缴税款的确定是根据国家相关税法和政策制定的。个人所得税的计算方式主要包括收入总额的确定和适用税率的计算。收入总额包括工资、薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费等各类收入。适用税率根据不同的收入水平划分为不同的档次，税率递进递减。应缴税款的确定是根据个人所得税的计算结果减去相应的减免项目，如子女教育、赡养老人等，最终确定应缴税款的金额。个人应及时履行申报纳税义务，按时缴纳个人所得税，以避免可能的罚款和法律风险。
个人所得税的计算方式和应缴税款的确定是根据国家相关税法和政策制定的。个人所得税的计算方式主要包括收入总额的确定和适用税率的计算。收入总额包括工资、薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费等各类收入。适用税率根据不同的收入水平划分为不同的档次，税率递进递减。应缴税款的确定是根据个人所得税的计算结果减去相应的减免项目，如子女教育、赡养老人等，最终确定应缴税款的金额。个人应及时履行申报纳税义务，按时缴纳个人所得税，以避免可能的罚款和法律风险。
结语：个人所得税是对个人所得进行征收的一种税收，按照工资收入金额减去各项社会保险费和起征点（5000元）计算应纳税所得额，再根据税率和速算扣除数计算应纳税额。个人所得税的计算方式和应缴税款的确定根据国家相关税法和政策制定。个人应及时履行申报纳税义务，以避免可能的罚款和法律风险。请注意，以上仅为个人理解，具体税务问题请咨询专业税务顾问。
法律依据
《中华人民共和国个人所得税法》第二条下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
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