法律分析：入职协议书要一式两份，很多公司一式两份也不会给劳动者一份这样是不公平的，一式两份就是公司和劳动者一人一份的意思。一式两份是为了方便合同的双方都能保留作为证明(或证据)，也便于双方清楚自己的权利义务。
根据《劳动合同法》第十六条第二款的规定：“劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份”。该条文将劳动合同由用人单位拿一份，劳动者拿一份劳动合同的意思明确予以规定，双方应依法履行。
一式两份的劳动合同放在单位保管就安全吗?员工是否需要自行保管自己的合同呢?
虽然单位提出保管劳动合同是为了员工考虑，但在法律上确实存在不合理性。因为根据《劳动合同法》规定，用人单位是应该提供一份合同给员工自己保管。除非员工要求单位代为保管，那另当别论。劳动部门既然将劳动合同设为一式两份，那就应该是用人单位、员工各一份，这样做既是对员工利益的保护也是对企业利益的保护。
入职协议书如何做到一式两份，完全一致
一份合同有一式两份以上的，如果合同双方都是企事业单位或其他组织，有公章，则可以用楼上空悟讲的办法，加盖骑缝章即可解决。
但如果说一方是自然人，或双方都是自然人，没有公章怎么办？
这时有以下方法：
1、逐页签字。以后有争议时，无签字无效；
2、骑缝手印。就象骑缝章一样，但因手指没有章的面积大，只能用于页数较少的。另外，一但有争议时，则需要鉴定指纹，这费用就大了；
3、办理公证。公证后公证处是要保存一份的，并且加盖编码章，装订成册，档案管理，不会有差错的。这是最有把握的，但需要付费的。
综上所述，对于入职协议书要一式两份吗这个问题的回答是肯定的。不只是入职协议书，我们知道，一般的协议书或者合同都是一式两份，双方每人持一份，这样的目的是预防一方更改协议书的内容另一方不知道，一式两份的话就可以更清楚了。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第十六条劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效。劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。
