2019年6月新公务员法实施后，公务员实行职务与职级并行制度，非领导职务全部改为职级，由原来的八个层级变为十二个层级，按照级别从大到小排序分别为:一级巡视员、二级巡视员、一级调研员、二级调研员、三级调研员、四级调研员、一级主任科员、二级主任科员、三级主任科员、四级主任科员、一级科员和二级科员。
在工资待遇上，四个级别的主任科员按照级别大小核发，有小幅区别，但差距不大。其中，四级主任科员和三级主任科员在车补、餐补、通讯补贴等福利性补贴，以及级别工资、年终考核绩效方面拿的都是同样标准，没有差距。区别主要是在职务工资等基础性工资方面，三级主任科员应发额要比四级主任科员高出100多元，扣除五险两金后实际也就增加几十元。同理，二级主任科员和一级主任科员在各类津补贴、级别工资和年终考核绩效方面拿的待遇也相同，只不过在基础性工资方面，一级主任科员比二级主任科员多300多块钱(应发)，扣除五险两金后实际到手增加160元左右。
如果全部按照扣除后的金额排序，一级主任科员比二级主任科员大概多160多元，二级主任科员比三级主任科员多110多元，三级主任科员比四级主任科员多70多元。当然，地区不同会有差异，一切以当地实际标准为准。
除了工资待遇方面的不同，四个层级的主任科员另一个区别是在晋升方面的优势。由于职级晋升不能跳级，一旦上了一个职级，相当于就掌握了晋升下一个职级的主动权，因此能够尽快实现晋升就可以占据有利位子，在政治待遇和发展前景上明显不同。这也是不同层级的职级在工资待遇之外的最大不同。
