只查封车辆不扣押的原因:
1、交警无权扣留法院查封的车辆。
从法律上，法院查封的车辆非正常行驶车辆，不能作为交警行政管理“相对人”，交警无权扣留这些车辆。
其次，任何单位、任何个人应服从、尊重生效法律裁定，维护司法的权威。人民法院对扣留查封车辆的交警可依法采取强制措施，包括拘留和罚款。
2、法院和交警是两个性质不同的国际机构，它们行驶国家权力的目的、功能各不相同。法院行驶司法权，交警行驶行政权。
行政权即行政机关依照一定的原则和方式，依自己的单方面意志对行政管理相对人做出某种行政处理决定的权力。法院查封扣押的车辆是否属于“行政管理相对人”关系到行政机关即本案中的交警是否有权对这些车辆作出处理决定。
3、查封车辆不在交警管辖的“行政管理相对人”范围内，所以交警无权扣留法院查封的车辆。
4、法院和交警是两个性质不同的
法律依据 :
《道路交通事故处理程序规定》
第三十九条
因收集证据的需要，公安机关交通管理部门可以扣留事故车辆，并开具行政强制措施凭证。扣留的车辆应当妥善保管。
公安机关交通管理部门不得扣留事故车辆所载货物。对所载货物在核实重量、体积及货物损失后，通知机动车驾驶人或者货物所有人自行处理。无法通知当事人或者当事人不自行处理的，按照《公安机关办理行政案件程序规定》的有关规定办理。
严禁公安机关交通管理部门指定停车场停放扣留的事故车辆。
第五十一条
公安机关交通管理部门应当与鉴定机构确定检验、鉴定完成的期限，确定的期限不得超过三十日。超过三十日的，应当报经上一级公安机关交通管理部门批准，但最长不得超过六十日。
