多发的部分工资应退还公司。公司发现多发工资给员工后,可以要求员工退还。公司在向员工讨要工资过程中,尽量说明原因,如果在涉及到个人所得税时,须向员工补偿税收差额。员工也要主动将多发的工资退还,如果员工不退还的,就会造成不当得利,按法律的规定也需要退还。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》第一百二十二条因他人没有法律根据,取得不当利益,受损失的人有权请求其返还不当利益。第九百八十七条得利人知道或者应当知道取得的利益没有法律根据的,受损失的人可以请求得利人返还其取得的利益并依法赔偿损失。