如果说员工不同意调岗而被辞退是可以申请经济补偿金的，那么在计算经济补偿金时也是会根据劳动者在本公司工作的年限和工资收入来计算的，如果说劳动者和用人单位对经济补偿金发放和金额产生了纠纷后，当事人双方也是可以通过申请劳动仲裁或者诉讼等方式解决的。
员工不同意调岗而被辞退，根据法律规定是可以申请补偿的。《劳动合同法》第三十五条的规定，变更工作岗位是对劳动合同的变更，不能协商一致的，劳动者可以拒绝调岗，因此被辞退的，有权申请经济补偿。
《劳动合同法》
第四十条，有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同:
(一)劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的;
(二)劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的;
(三)劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。
第三十八条，用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同:
(一)未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的;
(二)未及时足额支付劳动报酬的;
(三)未依法为劳动者缴纳社会保险费的;
(四)用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的;
(五)因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的;
(六)法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动者劳动的，或者用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全的，劳动者可以立即解除劳动合同，不需事先告知用人单位。
二、《劳动法》辞退员工补偿规定。
根据《劳动合同法》第46条规定，用人单位按照上述第36条、第40条、第41条的规定解除劳动关系的，应当向劳动者支付经济补偿。
第47条规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算;不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
除了上述情形以外，用人单位辞退员工的，就属于违法解除劳动合同，要按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金，即按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付二个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算;不满六个月的，向劳动者支付一个月工资的赔偿金。
如果说双方在签订了劳动合同后也是需要按照劳动合同的内容来执行的，如果说后期公司根据实际情况要求员工进行调岗后，也是需要先与劳动者进行协商的，如果说公司擅自进行人员调动就违反了劳动合同的约定，劳动者可以拒绝岗位调动甚至要求解除劳动合同的。
