员工擅自离职的处理有：
1、用人单位应当以书面形式送达通知书，限定员工在指定是时间内回公司上班，并提出如限期内不上班的处理措施；
2、当员工擅自离职达到可以辞退的标准时侯，用人单位以书面形式送达离职通知书给员工，通知其前来办理交接工作以及离职手续；
3、如果员工违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制的，造成用人单位损失的，要求员工赔偿损失。
一、解除劳动关系应当履行下列程序：
1、由解除决定人递交解除申请书；
2、人事部门填写解除劳动合同审批表并报主管审批；
3、通知所在部门及职工办理工作交接并交回工具设备等；
4、有关部门与职工办理结算工资福利和其他未了事宜等；
5、职工在结算工资和发放经济补偿的财务手续签字领取；
6、给职工办理团、工会组织关系和档案等转移手续；
7、给职工办理社会保险转移单和公积金转移手续等事项；
8、给职工开具解除劳动合同证明。
二、用人单位可以解除劳动关系的情况如下：
1、劳动者患病或者因工损伤，医疗期满后，不能从事原工作也不能从事由用人单位另行安排的工作；
2、劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作；
3、劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化时，致使原合同无法履行时，经当事人协商不能就变更劳动合同达成协议的。
员工擅自离职的处理方法
律师回答
摘要：员工擅自离职的处理是用人单位应以书面形式送达通知书，限定员工回公司上班并提出处理措施；当员工达到可辞退标准时，送达离职通知书，要求办理交接工作和离职手续；如违反保密或竞业限制，要求赔偿损失。解除劳动关系程序包括申请书、审批、工作交接、结算工资等手续。用人单位可解除劳动关系的情况包括劳动者病伤后无法工作、不能胜任工作、合同无法履行等。
延伸阅读
结语：合同解除的程序包括递交申请书、审批、通知交接工作、结算工资福利、办理转移手续等。用人单位可解除劳动关系的情况有劳动者病残、无法胜任工作、合同无法履行等。对于员工擅自离职，用人单位可采取书面通知、辞退措施，并要求赔偿损失。解除劳动关系需要遵循法定程序，确保合法合规。
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》
第三十七条劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
第三十七条劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
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