法律分析：一、员工迟到公司扣钱能申请劳动仲裁吗
公司按劳动者迟到的分钟数扣钱是合法的，除此之外，用人单位应依法在规章制度中明确上班迟到扣除工资的要求及标准，并已进行公开公示告知员工，且所扣工资必须少于劳动者当月工资的20%。
二、迟到公司扣钱合法吗的法律依据
《工资支付暂行规定》第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
三、迟到多久算旷工
迟到一天算旷工。旷工是指劳动者未请假或者请假未批准的缺勤行为。根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时。如果劳动者一天没有到岗工作即视为旷工。旷工当天，用人单位可以不支付工资，除了给用人单位造成了经济损失外，不得额外扣工资的。
法律依据：《工资支付暂行规定》第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
