员工的入职协议不是劳动合同。
劳动合同是全面详细约定用人单位与劳动者双方权利义务关系的书面文件，形式上要求纸质合同，内容上要求具备《劳动合同法》所规定的必备条款。
入职协议没有约定劳动合同权利义务的内容，仅能证明员工在单位开始就业，不能视为劳动合同。
没签劳动合同的处理方式有：
1、劳动者可以催告用人单位及时与其签订书面的劳动合同。
2、劳动者可以向劳动监察部门申诉，
3、申请劳动仲裁，要求用人单位支付违法辞退的赔偿金以及未签订合同的双倍工资，并补签劳动合同。
4、到法院起诉，对劳动仲裁不满的可以提起诉讼。
申请劳动仲裁的流程有：
1、去当地人力资源和社会保障局(原劳动局)内的劳动争议仲裁委，申请劳动仲裁，立案时需携带：仲裁申请书2份、申请人身份证复印件1份;相关证据复印件和证据清单2份;用人单位的工商登记信息(北京地区不需要提供登记信息)。
2、提交材料后，5个工作日仲裁委给予立案，然后给双方举证期，给对方答辩期;然后开庭审理，之后对劳动关系双方进行调解，调解不成仲裁委会下达裁决书;劳动仲裁60天内结案;对于裁决书不服，劳动者可以起诉到法院;
3、申请劳动仲裁期间，不耽误劳动者去新单位工作。
【法律依据】
《劳动合同法》第十条，建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。
已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
