补交土地使用权出让金所需要的材料有:补交申请书、土地使用证、土地转让协议、有关产权复印件、土地评估情况、土地管理部门批准意见等，具体情况下可以提交上述不同的材料来进行认定。
1、划拨土地使用权转让或补办出让申请报告3份(原件1份，复印件2份)。
2、单位主管部门同意转让的书面意见，若为股份制企业的须提供董事会决议3份(原件1份，复印件2份)。
3、原土地使用证3份(原件1份，复印件2份)。
4、过户后房屋所有权证复印件3份，原件需在窗口核对。
5、以协议方式交易的，提供转让协议3份(原件1份，复印件2份);以招、拍、挂方式交易的，提供招、拍、挂委托书、成交确认书复印件各2份(原件1份、复印件1份);由法院裁定的，提供法院裁定书、法院协助执行通知书3份(原件1份，复印件2份)。
6、需要测绘的提供土地测绘资料(含地籍调查资料)原件3份。
7、土地评估资料1份(原件)。
8、需征求市规划部门意见的，提供规划意见及规划红线图3份(原件1份，复印件2份)。
9、受让方企业法人营业执照或组织机构代码证、法定代表人身份证复印件3份。
10、土地行政主管部门同意交易的简复单3份(原件1份，复印件2份)。
11、地名有变动时，提供地名办出具的门牌号码证复印件3份。
12、土地登记申请表、土地登记委托书和法人代表身份证明书原件2份。
13、委托人与受托人身份证复印件2份。
14、国有土地使用权转让呈报表原件2份，窗口领取。
15、土地出让金缴付凭证第四联、土地契税缴付凭证第六联原件1份。
二、补充土地出让金时认定土地价款的具体范围
1、以招标、拍卖、挂牌和协议方式出让国有土地使用权所确定的总成交价款;
2、转让划拨国有土地使用权或依法利用原划拨土地进行经营性建设应当补缴的土地价款;
3、变现处置抵押划拨国有土地使用权应当补缴的土地价款;
4、转让房改房、经济适用住房按照规定应当补缴的土地价款;
5、改变出让国有土地使用权的土地用途、容积率等土地使用条件应当补缴的土地价款，以及其他和国有土地使用权出让或变更有关的收入等。
按照土地出让合同规定依法向受让人收取的定金、保证金和预付款，在土地出让合同生效后可以抵作土地价款。
国土资源管理部门依法出租国有土地向承租者收取的土地租金收入;出租划拨土地上的房屋应当上缴的土地收益;土地使用者以划拨方式取得国有土地使用权，依法向市、县人民政府缴纳的土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗补偿费、拆迁补偿费等费用(不含征地管理费)，一并纳入土地出让收入管理。
对于土地出让金的支付和处理，是需要严格基于上述法律规定的要求，提交上述材料后，由土地管理部门进行审查处理，在符合条件的情况下才可以办理土地使用权出让金的补交，如果存在违法行为的，还需要追究有关人员的法律责任。
