厂里罚款1000元是违法的，但法定条件下，公司可向员工索要经济损失赔偿金或违约金。
用人单位并不享有对劳动者罚款的权利。根据立法法及行政处罚法的相关规定，对财产的处罚只能由法律、法规和规章设定，目前法律并未赋予企业罚款权。
对员工罚款的法律后果：
1、退还罚款。
既然用人单位不可以对员工进行罚款，如果进行了罚款，就应当将罚款退还给员工。
2、支付经济补偿。
如果进行了罚款，而罚款通常是在劳动者工资中直接扣减的，如果罚款被认定成违法，那么会被认定为是未足额支付劳动报酬，而《劳动合同法》第三十八条规定，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者有权提出解除劳动合同，并依据第四十六条要求支付经济补偿。
如果是在规章制度中规定可以对劳动者进行罚款，劳动者可以《劳动合同法》第三十八条，用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的，提出解除劳动合同，并依据第四十六条要求支付经济补偿。
一、企业对员工罚款的规定：
国务院于1982年4月10日颁布的《企业职工奖惩条例》（国发[1982]59号），虽然规定了企业对职工给予行政处分和经济处罚的适用情形，但该条例已于2008年1月15日由国务院令第516号宣布废止，因此，用人单位对劳动者的罚款已没有相关的依据。
对于劳动者违反公司规章制度的处理：
虽然《劳动合同法》等相关法律不允许用人单位对劳动者罚款，但用人单位也并非没有救济途径维护自身的合法权益。
在现行法律框架内，用人单位有权以合法的方式对劳动者进行日常考核及管理，具体方式包括细化工资标准、考勤措施、记过、警告，甚至在严重损害用人单位利益的情况下，用人单位可以单方解除劳动合同，并要求劳动者赔偿损失。
法律规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
【法律依据】
《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
