一、领导违章指挥怎么处理
可以拒绝。劳动者拒绝用人单位管理人员违章指挥、强令冒险作业的，不视为违反劳动合同。
参照《中华人民共和国劳动合同法》第三十二条，劳动者拒绝用人单位管理人员违章指挥、强令冒险作业的，不视为违反劳动合同。
二、违章指挥处罚
违章指挥是对工程项目有指挥权的人对工程作业的违规指挥，如果是企业的法人或者其他履行职务的人发出的命令，一旦造成损失，对外当然由企业承担责任，该负责人主要在内部对企业承担责任。
但是如果触碰刑事，主要责任人员和相关负责人是要承担责任的，这一块的责任认定主要是涉及刑法中的强令违章冒险作业罪。
根据《刑法修正案(六)》第1条第2款的规定，犯本罪的，处5年以下有期徒刑或者拘役;情节特别恶劣的，处5年以上有期徒刑，依据情况及现实除以无上限的罚款及政治权利剥夺。情节特别恶劣，主要是指下列几种情况:(1)造成了特别严重的后果，如致多人死亡;或者致人重伤的人数特别多;或者直接经济损失特别巨大。(2)明知没有安全保证，甚至已发现事故苗头，仍然不听劝阻、一意孤行，拒不采纳工人和技术人员的意见，用恶劣手段强令工人违章冒险作业等。(3)事故发生后，行为人表现特别恶劣。如事故发生后，不积极采取抢救措施抢救伤残人员或防止危害后果扩大，只顾个人逃命或抢救个人财物，使危害后果蔓延扩大：或者事故发生后，为逃避罪责，破坏、伪造现场，隐瞒事实真相，嫁祸于人。
