法律分析：一、劳动合同被公司修改合法的吗?
劳动合同被公司修改是不合法的。如果劳动合同是用人单位单方面的更改，属于无效合同;如果劳动合同属于企业和劳动者协商同意的变更，那么属于有效合同。劳动合同确认为无效的，劳动者可以到当地人力资源与社会保障局申请仲裁，要求用人单位应当向劳动者支付已付出劳动的劳动报酬。
二、变更劳动合同有什么程序
1、提出变更的要约：用人单位或劳动者提出变更劳动合同的要求，说明变更合同的理由、变更的内容以及变更的条件，请求对方在一定期限内给予答复。
2、承诺：合同另一方接到对方的变更请求后，应当及时进行答复，明确告知对方同意或是不同意变更;
3、订立书面变更协议：当事人双方就变更劳动合同的内容经过平等协商，取得一致意见后签订书面变更协议，协议载明变更的具体内容，经双方签字盖章后生效。变更后的劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》
第三十三条，用人单位变更名称、法定代表人、主要负责人或者投资人等事项,不影响劳动合同的履行。
第三十四条，用人单位发生合并或者分立等情况,原劳动合同继续有效,劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。
第三十五条，用人单位与劳动者协商一致,可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同,应当采用书面形式。
变更后的劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。
