法律分析：(一)买家支付的税费
买家契税=3%成交价;另外还有交易手续费5元/平米;印花税=0.05%成交价，产权登记550元/户。
(二)卖家支付的税费
卖家出售的时候，商铺不论年限，都要交纳以下几种税费：
1、营业税及附加
税费为差额的5.56%
2、土地增值税
税费为差额扣除相关费用后的30%-60%(按差额比率不同累进计算)：
(1)增值额未超过扣除项目金额50%部分，税率为30%;
(2)增值额超过扣除项目金额50%，未超过扣除项目金额100%的部分，税率为40%;
(3)增值额超过扣除项目金额100%，未超过扣除项目金额200%的部分，税率为50%;
(4)增值额超过扣除项目金额200%的部分，税率为60%。
备注：土地增值税，不提供购入发票按总价3%计算。
3、个人所得税
税费为净收入的20%;不提供购入法票的按转让收入的1%计算。二手房交易个税，可参考《国税总局关于个人住房转让征收个人所得税的通知》相关规定。
对住房转让所得征收个人所得税时，以实际成交价格为转让收入。纳税人申报的住房成交价格明显低于市场价格且无正当理由的，征收机关依法有权根据有关信息核定其转让收入，但必须保证各税种计税价格一致。
对转让住房收入计算个人所得税应纳税所得额时，纳税人可凭原购房合同、发票等有效凭证，经税务机关审核后，允许从其转让收入中减除房屋原值、转让住房过程中缴纳的税金及有关合理费用。
(一)房屋原值具体为：
1、商品房：购置该房屋时实际支付的房价款及交纳的相关税费。
2、自建住房：实际发生的建造费用及建造和取得产权时实际交纳的相关税费。
3、经济适用房(含集资合作建房、安居工程住房)：原购房人实际支付的房价款及相关税费，以及按规定交纳的土地出让金。
4、已购公有住房：原购公有住房标准面积按当地经济适用房价格计算的房价款，加上原购公有住房超标准面积实际支付的房价款以及按规定向财政部门(或原产权单位)交纳的所得收益及相关税费。
已购公有住房是指城镇职工根据国家和县级(含县级)以上人民政府有关城镇住房制度改革政策规定，按照成本价(或标准价)购买的公有住房。
经济适用房价格按县级(含县级)以上地方人民政府规定的标准确定。
5、城镇拆迁安置住房：根据《城市房屋拆迁管理条例》(国务院令第305号)和《建设部关于印发〈城市房屋拆迁估价指导意见〉的通知》(建住房〔2003〕234号)等有关规定，其原值分别为：
(1)房屋拆迁取得货币补偿后购置房屋的，为购置该房屋实际支付的房价款及交纳的相关税费;
(2)房屋拆迁采取产权调换方式的，所调换房屋原值为《房屋拆迁补偿安置协议》注明的价款及交纳的相关税费;
(3)房屋拆迁采取产权调换方式，被拆迁人除取得所调换房屋，又取得部分货币补偿的，所调换房屋原值为《房屋拆迁补偿安置协议》注明的价款和交纳的相关税费，减去货币补偿后的余额;
(4)房屋拆迁采取产权调换方式，被拆迁人取得所调换房屋，又支付部分货币的，所调换房屋原值为《房屋拆迁补偿安置协议》注明的价款，加上所支付的货币及交纳的相关税费
(二)转让住房过程中缴纳的税金是指：纳税人在转让住房时实际缴纳的营业税、城市维护建设税、教育费附加、土地增值税、印花税等税金。
(三)合理费用是指：纳税人按照规定实际支付的住房装修费用、住房贷款利息、手续费、公证费等费用。
1、支付的住房装修费用。纳税人能提供实际支付装修费用的税务统一发票，并且发票上所列付款人姓名与转让房屋产权人一致的，经税务机关审核，其转让的住房在转让前实际发生的装修费用，可在以下规定比例内扣除：
(1)已购公有住房、经济适用房：最高扣除限额为房屋原值的15%;
(2)商品房及其他住房：最高扣除限额为房屋原值的10%。
纳税人原购房为装修房，即合同注明房价款中含有装修费(铺装了地板，装配了洁具、厨具等)的，不得再重复扣除装修费用。
2、支付的住房贷款利息。纳税人出售以按揭贷款方式购置的住房的，其向贷款银行实际支付的住房贷款利息，凭贷款银行出具的有效证明据实扣除。
3、纳税人按照有关规定实际支付的手续费、公证费等，凭有关部门出具的有效证明据实扣除。
买家支付的税费
1、房地产交易手续费：3元/平方米。
2、房屋登记费：550元/本(每增加一本证书按每本10元收取工本费)。
3、权证印花税：5元/本。
4、印花税：房屋产价的0.05%.
5、契税：交易价(或评估价)×3%.
卖家支付的税费
卖家出售的时候，商铺不论年限，都要交纳以下几种税费：
1、房地产交易手续费3元/平方米。
2、印花税：房屋产价的0.05%.
3、土地增值税：
a、可提供上手购房发票的，土地增值税=【转让收入-上手发票价(每年加计5%)-有关税金】×适用税率。
b、不能提供上手购房发票的，土地增值税=(转让收入-转让收入×90%)×30%.
4、个人所得税：
据实征收为(转让收入-房产原值-合理费用)×20%，核定征收为转让收入×7.5%×20%.转让收入-房产原值-合理费用相当于个人净收入。
5、营业税及附加税：
a、可提供上手购房发票的，为(转让收入-上手发票价)×5.5%.
b、不能提供上手发票的，为转让收入×5.5%.
c、税费为差额的5.56%
6、土地出让金：
商业用途用房，按其网格点基准地价的35%计收;
商业路线价区段路的商业临街宗地，加收路线价的10%;
办公用途用房按其网格点基准地价的30%计收。
7、土地出让金契税：
按本次征收土地出让金价款的3%征收。
商铺买卖业主要注意四大问题：
1.客户的购买能力。首先了解客户是否能够全款购房，如果客户是贷款购房，客户资质是否有问题必须落实，以免签定购房合同之后贷款不能按时到位从而造成买房纠纷。
2.付款方式。购买商业用房付款方式通常有全款购房、贷款购房、分期付款购房三种形式，尽量要选择全款购房客户，其次是贷款购房，其中贷款购买商铺，目前最高可以贷5成，年限最高为10年;最后是分期付款，尽可能减小卖房所承担的风险。
3.首付款与尾款间隔时间，时间不宜过长;因为商业用房大部分款项较大，所以变动也较大，所蕴藏的风险也相应较大，因此要尽量缩短首付款和尾款的间隔时间。
4.支付订金后的违约责任及违约罚则。支付订金之后的违约情况时有发生，所以支付订金后签定的订金收付合同中必须要明确违约责任和违约罚则。
