1、分包单位拖欠农民工工资的，由劳动保障部门责令支付工资，不支付的，由施工总承包单位代为支付然后向分包单位追偿。2、《保障农民工工资支付条例》第三十条规定，分包单位对所招用农民工的实名制管理和工资支付负直接责任。施工总承包单位对分包单位劳动用工和工资发放等情况进行监督。分包单位拖欠农民工工资的，由施工总承包单位先行清偿，再依法进行追偿。工程建设项目转包，拖欠农民工工资的，由施工总承包单位先行清偿，再依法进行追偿。风险提示：工程欠款的相关注意事项：1、施工企业要预防拖欠工程款发生，加强企业管理，特别要加强对施工合同、施工质量、工期的管理。要调整经营结构，将承包工程的重点放在有实力、信誉比较好的业主和项目上。承接任务时必须对业主的业绩、资信进行详细的调查，对待垫付资金等工程要十分谨慎，要将垫付工程提高到投资行为管理的高度来对待。2、对已拖欠的工程款，要认真做好清欠工作，组建专门机构，成立由公司、分公司、项目部三级清欠小组，建立拖欠款回收月报表制度，要把责任指标落实到部门和人头。对于态度恶劣、有钱不还，故意赖账的业主应不惮于诉诸法律。
违法分包导致的拖欠农民工工资案件是谁督办
1、依据我国相关法律的规定，违法分包导致的拖欠农民工工资案件由住房城乡建设、交通运输、水利等相关行业工程建设主管部门督办。2、《保障农民工工资支付条例》第七条规定，人力资源社会保障行政部门负责保障农民工工资支付工作的组织协调、管理指导和农民工工资支付情况的监督检查，查处有关拖欠农民工工资案件。住房城乡建设、交通运输、水利等相关行业工程建设主管部门按照职责履行行业监管责任，督办因违法发包、转包、违法分包、挂靠、拖欠工程款等导致的拖欠农民工工资案件。发展改革等部门按照职责负责政府投资项目的审批管理，依法审查政府投资项目的资金来源和筹措方式，按规定及时安排政府投资，加强社会信用体系建设，组织对拖欠农民工工资失信联合惩戒对象依法依规予以限制和惩戒。财政部门负责政府投资资金的预算管理，根据经批准的预算按规定及时足额拨付政府投资资金。公安机关负责及时受理、侦办涉嫌拒不支付劳动报酬刑事案件，依法处置因农民工工资拖欠引发的社会治安案件。司法行政、自然资源、人民银行、审计、国有资产管理、税务、市场监管、金融监管等部门，按照职责做好与保障农民工工资支付相关的工作。风险提示：为了避免结算风险和杜绝包工头等转嫁风险搞投机，要尽量杜绝把工程转包或违法分包。更不要为了一点可怜的管理费允许他人挂靠，因为那是“百分之几的收益，百分百的风险”。如果存在转包、分包或挂靠，要采取控制风险的措施，向实际施工人处派驻监督人员，作好质量、工期控制，尤其做好财务控制。
