法律分析：一、个人所得税是按应发工资还是实发工资计算
在缴纳个人所得税时，是按实发工资计算的。实发工资也称应得工资，即劳动者应当实际得到或者用人单位应当实际支付给劳动者的工资报酬。当事人每月应缴的个人所得税额=应纳税所得额*适用税率-速算扣除数。
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》第六条
应纳税所得额的计算：
（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。
（二）非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额；劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额。
二、应纳税所得额的计算：
(一)居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。
(二)非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额;劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额。
(三)经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额。
(四)财产租赁所得，每次收入不超过四千元的，减除费用八百元;四千元以上的，减除百分之二十的费用，其余额为应纳税所得额。
(五)财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额。
(六)利息、股息、红利所得和偶然所得，以每次收入额为应纳税所得额。
三、个人所得税怎么申报
纳税人可以采取数据电文、邮寄等方式申报，也可以直接到主管税务机关申报，或者采取符合主管税务机关规定的其他方式申报。
纳税人在子女教育、继续教育、住房贷款利息、住房租金、赡养老人以及大病医疗这6个方面的支出，在缴纳个人所得税时可以申请专项附加扣除，扣除后会减少纳税人的税费支出。国家为了方便纳税人填报专项附加扣除信息，国家税务总局推出的个人所得税APP已上线，开放了个人所得税专项附加扣除功能，个人所得税可以通过国家税务总局推出的个人所得税APP进行申报。
四、个人所得税退税的方式
（一）申请人自行申请退税：可于每年3月1日至6月20日之间，通过税务局网站、个人所得税手机APP、邮寄申办、或者直接前往办税服务大厅等方式进行办理年度汇算，并结清应退税款；
（二）委托公司代缴个税人员协助办理退税：纳税人可向任职所在公司提供上个纳税年度在本公司之外的综合所得收入、相关扣除信息以及享受税收优惠等信息资料，委托公司负责代缴个税的工作人员协助进行纳税申报并办理退税；
（三）委托涉税专业服务单位或者个人代为退税。
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》第六条
应纳税所得额的计算：
（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。
（二）非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额；劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额。
