法律分析：一、合同到期了,但有被扣工资还可以解除劳动合同吗
现在有许多劳动者都有这样一个疑问，就是合同到期后想要离开现在的公司去其他的更有发展或者更好的公司工作。但是公司又不替自己办理相应的离职手续，或者不发放相应的工资要求劳动者留下来。那么面对这个问题，劳动者应该如何处理呢
首先劳动合同到期，劳动关系就终止，劳动者可以不续签劳动合同，用人单位应当为劳动者结算工资。
其次用人单位拖欠工资报酬，劳动者搜集证据，计算出工资数额，可以向劳动行政部门投诉，或者向用人单位所在地或者劳动合同履行地的劳动人事争议仲裁委申请仲裁。
最后用人单位不替劳动者办理相应手续也是违法行为，劳动者可以向劳动行政部门投诉，或者向用人单位所在地或者劳动合同履行地的劳动人事争议仲裁委申请仲裁。
二、劳动合同到期了，我要离职，公司还要扣我工资违法吗？
可以去劳动局申诉。
员工提前一个月（试用期提起三天）书面向单位申请离职，或者与单位协商经过单位同意，或者单位有违法情形的，当事人都可以离职。单位故意刁难不让离职，是违法的，可以去劳动行政部门申诉。
但是非全日制用工，是无需提前书面申请的，当天口头申请就可以结束用工关系。
但是如果提前申请离职，劳动合同有依法约定培训费等协议的，当事人需要与单位协商给予合理的补偿。
另外，用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
对行业竞争要求保密的单位，如果有补偿，当事人离职后还要遵守相关的要求，如果违约，还要赔偿单位。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》第五十条
工资应当以货币形式按月付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条
有下列情形之一的，劳动合同终止：
(一)劳动合同期满的
(二)劳动者开始依法享受基本养老保险待遇的
(三)劳动者死亡，或者被人民法院宣告死亡或者宣告失踪的
(四)用人单位被依法宣告破产的
(五)用人单位被吊销营业执照、责令关闭、撤销或者用人单位决定提前解散的
(六)法律、行政法规规定的其他情形。
