具体区别如下：
1、稳定性不同
备案制和事业编一样,意味你拥有一份非常稳定的工作,除非违法,否则一般都不会被解聘。
合同制就不一样了,医院不用你了可以解除劳动合同
2、保险不同
备案制和事业编享受的工资待遇都是按照人社部门规定的标准来计发,可享受五险二金(即养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险和住房公积金、职业年金)的社会保障。
合同工按照医院自己规定,有些三级以下的医院都不给保险。
3、待遇不同
备案制就是将原来合同工的待遇提高,但又不是“铁饭碗”。只是医院和医生互相选择的范围更大些,合同到期,医院与医生可以续签,也可以不签,使得医生自由执业的可能性更大。
备案制和事业编的最主要区别就是备案制是合同制,体制外的,并不是正式的。而事业编制就是编内的,体制内的,是正式的。事业编制,是指为国家创造或改善生产条件、增进社会福利,满足人民文化、教育、卫生等需要,其经费一般由国家事业费开支的单位所使用的人员编制。
法律依据：
《事业单位人事管理条例》
第二条
事业单位人事管理，坚持党管干部、党管人才原则，全面准确贯彻民主、公开、竞争、择优方针。国家对事业单位工作人员实行分级分类管理。
