法律分析：一、员工旷工三天怎么处理
旷工按公司规章处理。旷工的处理一般是用人单位的制度和纪律问题，用人单位可以按照自己的规章制度处理，我国《劳动合同法》中对旷工三天能不能辞退并没有明确的规定，劳动合同法只规定违反用人单位的规章制度，如果公司制度中有该规定，旷工三天是属于违反公司制度的，可以进行辞退，与劳动者解除劳动合同。
根据国务院《企业职工奖惩条例》第十八条的规定
职工无正当理由经常旷工，经批评教育无效。连续旷工时间超过十五天，或者一年以内累计旷工时间超过三十天的，企业有权予以除名。
从这个规定来看，员工连续旷工超过十五天，或者一年累计超过三十天的，可以将其开除。这个是国务院颁布的行政法规，直接规定了员工旷工多久，企业可以开除员工的规定，但是目前该行政法规已经废止，不再适用了。
因此，对于员工旷工多久，用人单位可以将其开除，法律上并没有明确的天数，用人单位要结合本单位的生产经营情况，自行制定规章制度进行合理规定。
二、员工旷工三天辞退需要支付补偿金吗
员工旷工三天是属于违反公司制度行为的，单位可以以此辞退员工，并且可以扣除员工部分奖励性待遇作为处罚，结清员工工资即可，单位是可以不用支付员工补偿金的。但是公司的规章制度经过民主制定,并且公示过,员工签字确认同意的,如果是这样的话,即使员工去仲裁都没有问题。公司也会胜诉。公司规章制度中规定此行业属于严重过失,可以辞退的话，就不用支付补偿金。
三、员工旷工三天扣工资合法吗
员工旷工三天扣工资是合法的。
员工旷工3天主要是按照公司章程来处理，若是公司制度规定了旷工三天需辞退，那么单位是可以辞退，或者是扣工资，都是可以的。因为员工旷工三天而解除劳动关系的，只要是单位的公司制度有公示并且员工签名确认过的，辞退员工是不用支付补偿金的。
法律依据：《企业职工奖惩条例》第十八条的规定
职工无正当理由经常旷工，经批评教育无效。连续旷工时间超过十五天，或者一年以内累计旷工时间超过三十天的，企业有权予以除名。
