在休息日扣工资的这种行为是不合法的，按照职工工作时间的规定，其实企业每个礼拜都应该正常保证员工的休息日，每周工作的时间就是40个小时，在休息日不仅不能扣工资，如果休息日被安排加班的话，还应该按照平时工资的两倍支付加班费。
不合法，可依法向劳动监察部门举报投诉或申请劳动仲裁维权，而且，如果安排在法定节日上班，必须支付三倍的工资。安排在周六、日休息日上班，如不能安排补休的，必须支付二倍的工资。安排在工作日延长工作时间的，必须支付1.5倍的工资。如果单位有违反法律规定的，可到劳动保障部门举报。亦可申请劳动争议调解、仲裁。对仲裁结果不服的，可向法院提起诉讼，依法维护自己的权益。
根据《国务院关于职工工作时间的规定》的规定，职工每日工作8小时、每周工作40小时，任何单位和个人不得擅自延长职工工作时间。
二、企业不按时发工资有哪些法律后果?
用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果企业拒绝支付劳动者报酬的，劳动者可以提起
1、劳动者可以解除合约
第三十八条用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同:
(一)未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的;
(二)未及时足额支付劳动报酬的;
(三)未依法为劳动者缴纳社会保险费的;
(四)用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的;
(五)因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的;
(六)法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动者劳动的，或者用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全的，劳动者可以立即解除劳动合同，不需事先告知用人单位。
根据《劳动合同法》第三十八条规定，用人单位对劳动者未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同。
2、支付赔偿金
《劳动法》第九十一条:“用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令其支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令其支付赔偿金:
(1)克扣或者无故拖欠劳动者工资的;
(2)拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的;
(3)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的;
(4)解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。”
可以看出，无故拖欠职工工资，资方要支付拖欠工资、补偿金(25%拖欠工资额)，必要时还要支付赔偿金(但要以造成实际损害为前提)。
因为休息日不上班，所以休息日的话肯定是没有业绩奖金的，但基本工资是不能非法扣除的。周六周日，法定节假日，这时候员工本人都属于带薪休假。当然，事实上也有很多的特殊工作岗位可能一年365天都没有休息日，这就需要用人单位合理安排好轮休。
